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植物RNA的提取
更新時(shí)間:2011-04-27   點(diǎn)擊次數(shù):2267次

www.chem17.com/st175729/product_4737054.html有許多植物就是由于未能有效地分離純化其組織中的RNA, 而阻礙了其分子生物學(xué)方面研究的進(jìn)展。這些植物組織中,或富含酚類化合物,或富含多糖,或含有某些尚無法確定的次級(jí)代謝產(chǎn)物,或RNase的活性較高。在完整的細(xì)胞內(nèi)這些物質(zhì)在空間上與核酸是分離的,但當(dāng)組織被研磨,細(xì)胞破碎后,這些物質(zhì)就會(huì)與RNA相互作用。酚類化合物被氧化后會(huì)與RNA不可逆地結(jié)合,導(dǎo)致RNA活性喪失及在用苯酚、氯仿抽提時(shí)RNA的丟失,或形成不溶性復(fù)合物;而多糖會(huì)形成難溶的膠狀物,與RNA共沉淀下來;萜類化合物和RNase會(huì)分別造成RNA的化學(xué)降解和酶解。對(duì)于這些植物材料,用常規(guī)的RNA提取方法(如胍法、苯酚法和十六烷基*基溴化胺法等)難以提取出其RNA!

縱觀上RNA提取的試劑盒,如常見的TRIzol,以及一些的RNA提取試劑盒均很難從多糖多酚的植物中提取高質(zhì)量的RNA,酚類物質(zhì)的含量會(huì)隨著植物的生長而增加。因而從幼嫩的植物材料中更容易提取RNA。此外,針葉類植物的針葉中多酚的含量比在落葉植物的葉子中要高得多。在植物材料勻漿時(shí),酚類物質(zhì)會(huì)釋放出來,氧化后使勻漿液變?yōu)楹稚?,并隨氧化程度的增加而加深,這一現(xiàn)象被稱為褐化效應(yīng)。被氧化的酚類化合物(如醌類)能與RNA穩(wěn)定地結(jié)合,從而影響RNA的分離純化;多糖的污染是提取植物RNA時(shí)常遇到的另一個(gè)棘手的問題。植物組織中往往富含多糖,而多糖的許多理化性質(zhì)與RNA很相似,因此很難將它們分開。在去除多糖的同時(shí)RNA也被裹攜走了,造成RNA產(chǎn)量的減少;而在沉淀RNA時(shí),也產(chǎn)生多糖的凝膠狀沉淀,這種含有多糖的RNA沉淀難溶于水,或溶解后產(chǎn)生粘稠狀的溶液。由于多糖可以抑制許多酶的活性,因此污染了多糖的RNA樣品無法用于進(jìn)一步的分子生物學(xué)研究。

Trizol主要成份是異硫氰酸胍和苯酚,沒有特殊去除多糖和多酚的試劑,所以對(duì)于大多數(shù)多糖多酚的植物無法成功提取,即使添加了如2-巰基乙醇、二硫蘇糖醇(DTT)或半胱氨酸之類的防止酚氧化的試劑也很難提取。RNeasy Plant Mini Kit主要裂解液是鹽酸胍或則異硫氰酸胍。

 

 

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